根据国务院《关于落实科学发展观加强环境保护的决定》和《2007年自然生态保护工作要点》等有关要求，针对我国实际情况，2007年，我国着力解决影响可持续发展的若干生态问题，全国自然生态保护工作取得了新进展和新成效。
全国自然生态保护工作取得新进展首先体现在加强自然生态保护法规、政策和标准的制订方面。
原国家环保总局、农业部办公厅联合征求国务院相关部门的意见，完成了《畜禽养殖污染防治条例》(征求意见稿)；印发了《国家环保总局关于进一步加强生态保护工作的意见》；完成《自然生态系统外来入侵物种管理办法》(草案)和《环保用微生物菌剂进出口环境安全管理办法》(征求意见稿)。国务院办公厅转发了原国家环保总局等8个部门《关于加强农村环境保护工作的意见》，明确了农村环境保护的总体要求。
随后，全国一些省区也先后出台或正在制订有关生态保护的法规或规章。按照党中央、国务院关于建立生态补偿机制的一系列要求，国家有关部门和地方政府积极探索制定生态补偿政策。原国家环保总局印发了《国家环保总局关于开展生态补偿试点工作的指导意见》。
安徽省新安江流域生态补偿机制研究工作已进入实质性阶段，同时还开展了皖西大别山——淠史杭灌区生态补偿机制研究，将为实施大别山生态保护和发展打下良好的基础。
河南省制定了《矿山生态环境治理恢复保证金管理暂行办法》、《钼矿资源开发整顿实施方案》等文件，强化在矿山开发中生态修复措施的落实，目前确定了煤炭企业暂按5元/吨·煤标准提取生态补偿费列入成本，专项用于矿区生态恢复与环境治理方面的投资。
全国自然生态保护工作以生态示范创建为抓手，积极推进生态环境保护和建设。
全国印发了《国家环保总局关于加强生态示范创建工作的指导意见》，修订并印发了“生态省(市、县)建设指标”。目前，全国已有14个省区开展了生态省(区、市)建设，150多个市(县、区)开展了生态市(县、区)创建工作，6个市(县、区)已被命名为国家市(县、区)，2007年，又有8个市(县、区)提出考核申请。
近年来，随着全国生态示范创建工作的开展，积极引导各地走上了可持续发展的道路。突出表现在:第一，创建地区公众环境保护意识增强，可持续发展理念正在不断被接受并逐步内化为立县(市、区)的基本策略；第二，通过实施生态示范创建规划，不断优化区域经济发展格局，粗放的发展方式逐渐淡出或被淘汰，发展的可持续性不断增强；第三，通过开展生态示范创建活动，一些生态良好、但经济欠发达地区的发展后劲开始显现，经济效益和生活水平明显提高。
全国自然生态保护工作以畜禽养殖和面源污染治理为核心，强化农村环境保护工作。
原国家环保总局编制并印发了《全国农村环境污染防治规划纲要》；印发了一套农村环境保护宣传挂图。各地加大畜禽养殖专项整治，加强农业面源污染防治工作。
2007年，北京市继续组织完成50家规模化养殖场污染综合治理工作。黑龙江省组织开展了秸秆禁烧年度专项执法检查，基本上杜绝了因焚烧秸秆影响交通和环境污染事故的发生；积极发展生物质能源，积极推进秸秆的综合利用。
江苏省编制完成《农村环境综合整治规划》，开展了全省年度农村环境综合整治情况检查；拟定了农村清洁工程指标体系、考核办法；制定并颁发了《农村环境综合整治考核办法》和《江苏省农村环境综合整治以奖代补专项资金管理办法》，向全省150个行政村下拨补助资金3000万元，起到了很好的激励和示范作用。
自然生态保护工作取得新进展还体现在我国已全面开展土壤污染状况调查，加强土壤污染防治工作。
截至2007年10月，全国26个省、自治区、直辖市共采集土壤和农产品等样品36287个，完成了30590个样品的分析测试，获得近85万个有效调查数据，制作图件1759件，累计培训6500多人次，中央财政安排1.2亿元，地方财政配套1.1亿元。山西、辽宁、浙江、江苏、湖北、湖南、广东、四川、云南和甘肃等省，在采集样品数量、完成样品分析测试、获得有效调查数据以及落实配套资金等方面措施得力，成效明显。
辽宁省注重组织领导，省及所辖14个市都成立了专门的机构，注重总结交流经验，围绕调查撰写论文30多篇。
江苏省坚持“紧扣国家目标，兼顾江苏省情；有机无机统查，侧重有机毒物；加强成果集成，服务地方建设”的基本原则，思路清晰，定位准确，工作有特色。土壤调查被列入2006年度省委、省政府1号文件，省财政安排了配套资金，保证了调查的顺利进行。
湖南省把土壤调查列入各市州环保工作目标责任制考核内容；科学调度，合理安排采样和分析测试工作，从市州监测站抽调技术骨干集中到省监测站，轮班作业，提高了工作效率。
四川省省政府办公厅专门下发了《关于开展土壤污染状况调查工作的通知》，副省长刘晓峰多次对土壤调查做出批示，并亲自到土壤样品流转中心检查指导，极大地鼓舞了调查人员的积极性。
云南省自加压力，在实施方案中增加了农业敏感区、九大高原湖泊区的点位；通过技术攻关，在全省填补了有机氯农药、酞酸酯和多环芳烃等有机物监测分析方法的空白。
自然生态保护工作要以生物物种及栖息地保护为重点，逐步提高管护水平。
2007年，国务院批准新建了19处国家级自然保护区，使一批重要物种及其栖息地的保护得到了加强。原国家环保总局印发了《全国生物物种资源保护与利用规划纲要》并召开了新闻发布会；参加了“中俄跨界保护区和生物多样性保护工作组”第一次会议；召开了“生物多样性日纪念大会”；联合有关部门共同完成《中国履行卡塔赫纳生物安全议定书第一次国家报告》并提交《生物多样性公约》秘书处；正在编制《中国生物多样性保护战略与行动计划》、《全国转基因生物安全管理规划》、《国土生态安全格局规划》；以辽宁省为试点，组织有关部门开展了国家级自然保护区评估；与国土资源部、农业部、水利部组成联合检查组，对内蒙古自治区4个国家级自然保护区的建设管理情况进行了专项检查，对一些保护区存在的问题提出了处理意见，并要求进行整改；中欧生物多样性项目2007年启动了18个地区示范项目，共争取投资2100万欧元；争取自然保护区建设费用8000多万元。
黑龙江省开展松花江流域自然保护区专项执法检查；修编了《黑龙江省自然保护区“十一五”建设规划》，并协调与有关规划相衔接，通过沟通和协调，将自然保护区建设项目纳入了《东北经济区生态环境保护和建设规划》。
自然生态保护工作以生态功能区划为切入点，强化资源开发活动的环境监管。
针对这项内容，原国家环保总局印发了《国家重点生态功能保护区规划纲要》并召开了新闻发布会；编制完成《全国生态保护远景规划》(送审稿)、《全国生态脆弱区保护规划》(送审稿)。各地积极推进规划编制工作。
与此同时，原国家环保总局还启动了《矿山环境保护条例》的起草工作，赴湖南和江苏两省开展矿山立法调研；开展了旅游资源开发的环境保护专项调研，加强资源开发的环境保护监管工作。
北京市组织编制了《固体矿山生态修复标准》(北京市地方标准)，开展《北京市山区关停废弃矿山植被恢复规划》(2007～2010)制定工作，指导2007年北京市重点地区废弃矿山植被恢复工程项目的实施。
全国自然生态保护工作虽然取得新成就，但仍存在问题及薄弱环节。
虽然2007年全国自然生态保护工作取得了新进展，但仍然存在一些问题和薄弱环节，主要表现在，一是农村环境保护工作以农村污染防治为载体取得了新的进展，但总体上仍处于起步阶段，需要进一步理清工作思路，整合部门资源，强化培训和宣传，加大资金投入和项目支持力度。
二是自然生态保护工作涉及面广，部门职责有交叉，自然生态保护与地方经济发展和项目建设矛盾增多，自然生态保护监管难度加大。
三是开展调查研究不足，对基层环保部门的业务指导力度不够。
四是自然生态保护基础工作薄弱，缺乏必要的制度和手段，生态补偿机制和生态功能保护区建设工作还未全面开展。
五是受管理体制的制约，自然生态保护法规制订工作难度大，生态保护工作法规依据不足。
