前一阶段，我国3岁以上人群大规模接种实践已证明国产甲型H1N1流感疫苗安全有效。3岁以下儿童是甲型H1N1流感的高危易感人群，为有效保护该人群健康，经卫生部和国家食品药品监督管理局批准，12月初开始，在科技部863计划的支持下，由中国疾病预防控制中心牵头，先后组织北京科兴、浙江天元和上海生物制品研究所3家疫苗生产企业陆续在广西、江苏和湖南3省疫苗临床试验基地展开6-35月龄儿童甲型H1N1流感疫苗临床试验。此次临床试验采用随机、双盲、设对照的设计；严格按照“知情、同意、自愿”的原则进行受试者招募；免疫程序为2针次，首针接种剂量为15μg，第21天接种第二针7.5μg。
目前，各基地均已完成6-35月龄儿童甲型H1N1流感疫苗临床试验受试者招募及首针疫苗的接种工作。3个疫苗临床试验基地共入组935人，其中6-12月龄209人，1岁组363人，2岁组363人，未发现严重不良反应。12月23日起，第二针疫苗接种工作将在3个临床试验基地陆续展开。
