根据国务院关于三峡工程2006年汛末蓄水156米的批示，以及国家防汛抗旱总指挥部和长江防汛总指挥部关于156米蓄水期三峡水库水位调度控制意见，三峡工程于9月20日22时开始启动156米蓄水，比初步设计蓄水计划提前一年。

    此次三峡蓄水将采取分阶段抬高水位的方式，根据蓄水安排，三峡水库坝前起调水位为135.7米，9月25日前坝前水位不超过144米，9月30日坝前水位不超过148米，在148米水位时暂停蓄水两天，开展安全监测各项工作，然后继续蓄水10月中旬达到156米。蓄水方案统筹兼顾了防洪、发电、航运调度，统筹兼顾了社会效益、生态效益和经济效益，统筹兼顾了上游地质灾害防治和下游供水，并始终把防洪、下游供水等社会效益放在首位。为满足三峡水库下游用水需求，9月下旬水库下泄流量按不低于8000立方米/秒控制，当遇下游水位特低情况，可视下游用水需求对下游适当补水；当入库流量超过46800立方米/秒时，三峡水库按遭遇大洪水情况，实行保枢纽工程安全的调度方式运行。

    按照初步设计要求，三峡工程总工期为17年，分围堰挡水发电、初期运行和正常运行三期建设，三峡水库水位分别蓄至135米、156米和175米。156米蓄水完成后，三峡水库将具有防洪库容110亿立方米，已投产的14台机组发电出力达到额定的70万千瓦，电站的发电量以及调峰能力都将有较大提高，可向电力系统提供稳定的电能。提前一年蓄水至156米，三峡电站将多发电78.50亿千瓦时。同时，三峡工程将发挥更大的航运效益。自三峡坝址三斗坪以上，航道改善里程将达到570公里，比135米蓄水高程延伸140公里左右，重庆长寿以下的涪陵、万州等港口水深条件将大为改善，成为深水良港。

    为了确保三峡工程蓄水顺利进行，中国三峡总公司组织成立了三峡水库156米蓄水领导小组，负责协调蓄水期间的水调、电调、航运、漂浮物处理等事项，蓄水过程中将密切关注来水变化，加强对枢纽和水库的监测，确保蓄水安全。