为加快建立有利于资源节约和环境保护的财税制度，推进经济增长方式实现根本性转变，针对廉价或无偿使用资源造成资源浪费和环境污染日益加剧的问题，启动了以煤炭资源为试点的矿产资源有偿使用制度改革。改革以深化煤炭资源探矿权采矿权有偿取得和建立煤炭资源勘查、开发合理成本负担制度为核心；以加大煤炭资源勘查的支持力度，完善煤炭资源税费政策，加强煤炭资源开发管理和宏观调控，促进煤炭资源合理有序开发，不断提高煤炭资源回采率为目标。改革的政策措施主要有五个方面：一是严格实行煤炭资源探矿权、采矿权有偿取得制度；二是将煤炭资源勘查作为中央财政地质勘查基金（周转金）支持重点；三是建立煤矿矿山环境治理和生态恢复责任机制；四是合理调整煤炭资源税费政策；五是加强煤炭资源开发管理和宏观调控。此项改革是财税政策推进经济增长方式转变的重要举措。国务院召开全国电视电话会议对试点改革工作进行了动员和部署，从2006年起，试点改革工作在山西、内蒙等8个煤炭主产省全面推开，相关配套政策均已出台。2007年底，将对试点工作进行评估、总结提出进一步完善矿产资源有偿使用制度改革的政策建议。

    针对当前部分企业肆意排污而不顾忌环境成本，环境保护缺乏内在约束和激励机制的问题，财政部提出了以排污权有偿取得和排污权交易改革为突破口，推进环境有偿使用制度改革的总体思路。具体是：在“总量控制”的前提下，实行排污权有偿取得，政府将排污权有偿出让给排污者，改变目前企业随意排污而不顾忌成本的状况，同时允许排污权进行交易，以使企业在利益的驱动下，珍惜有限的排污权，减少污染物的排放，并可因减少排放而受益。排污权有偿取得和排污权交易改革涉及体制改革，十分复杂，初步考虑，拟在某一行业或某一流域内先行试点，在探索经验的同时，抓紧相关政策的建立和完善。