2006年，农业税走进历史博物馆，农业特产税彻底取消，烟叶税条例制定出台，标志着国家和农民的传统分配关系发生了根本性变革，扭转了长期以来农民负担过重的局面，迈出了统筹城乡发展的新步伐，农村税费改革取得了重要阶段性成效。与改革前的1999年相比，2006年全国农民共减轻负担约1250亿元，人均减负约140元。为支持农村税费改革，中央和地方在进行体制创新的基础上，积极调整财政支出结构，不断加大农村税费改革转移支付力度（见下表）。