2006年是"十一五"的开局之年，也是政府采购制度改革由初创阶段向全面发展阶段转变的关键之年。政府采购制度改革工作以科学发展观为统领，以"十一五规划"和中央纪委再次提出的深化和健全政府采购制度要求为契机，在进一步扩大政府采购范围和规模，发挥政府政策功能，推进规范化管理和监督检查等方面继续深化创新，不断推进政府采购制度改革工作。

    2006年，政府采购制度体系进一步完善，政府采购规模持续增长，预计突破3500亿元；重点做好政府采购领域治理商业贿赂工作，取得阶段性进展；兼顾社会效益，发挥政府采购制度的政策功能，在政府采购支持节能、节水、环境标志产品、自主创新产品等方面发挥了导向作用；政府采购机构不断健全，运行机制日趋协调，初步建立了财政部门、集中采购机构、采购人职责清晰、运转协调的工作机制；公开招标方式的主导地位基本确立，公开招标采购规模已达到政府采购总规模的70％以上；采购透明度不断提高，在财政部指定媒体上发布的信息数量从2002年的5000多条增加到2006年的近8万条；基本建立了较为完善的投诉处理机制，2006年财政部收到16起投诉和举报，受理14起，都及时作了处理；建立了政府采购代理机构资格认证制度，组织专门力量开展资格认定工作，已审批和确认了600多家甲级资格政府采购代理机构。

    WTO《政府采购协议》研究工作全面展开。2006年4月，我国政府在第17届中美商贸联委会上承诺，将于2007年12月底前提交政府采购市场开放清单，启动加入WTO《政府采购协议》（GPA）谈判。国务院要求财政部尽快制订工作方案，做好相关工作，为启动谈判做好准备。财政部全面展开了GPA研究工作。同时，加强了国际沟通与合作。5月16日，作为中欧政府采购对话机制的重要内容，中欧首次政府采购对话在京举行。2月28日，我国就加入WTO《政府采购协议》与美国举行了首次技术性磋商。4月26－27日，财政部与亚洲开发银行、世界银行联合举办了电子化政府采购国际研讨会。此外，财政部还参加了多次中澳等自由贸易区双边磋商、WTO政府采购委员会会议、APEC政府采购专家组会议，以及联合国电子化政府采购能力建设研讨会等活动。