在充分酝酿与协商的基础上，2006年10月16日，科学技术部、四川省人民政府在成都签订《科学技术部、四川省人民政府工作会商制度议定书》并召开部省第一次工作会商会。科技部党组书记、部长徐冠华，四川省委副书记、省长张中伟，省委副书记、常务副省长蒋巨峰，省委副书记甘道明，省人民政府副省长柯尊平，科技部副秘书长王志学，科技部、四川省有关部门负责人出席了会议。会议由王志学副秘书长主持，省委副书记、常务副省长蒋巨峰同志宣读《部省工作会商制度议定书》，柯尊平副省长介绍了四川省的相关情况。徐冠华部长、张中伟省长分别代表科技部和四川省人民政府在议定书上签字，并作了重要讲话。

    《科学技术部 四川省人民政府工作会商制度议定书》明确了六个方面的主题和会商内容：一是共同推进绵阳科技城、成都高新区的发展；二是共同推进中医药现代化和国际化；三是共同推进钒钛新材料产业发展；四是共同推进生物技术产业的发展；五是共同推动有关的国家重大科技项目在四川实施，加强四川科技基础条件平台建设；六是共同推进体制机制改革，加快四川区域创新体系建设。

    张中伟省长表示，四川将以这次建立部省工作会商机制为契机，把四川的科技优势进一步转化为经济优势。将与科技部一道，以发挥四川科技资源比较优势，提高区域创新能力为重点，共同推进具有四川特色的科技产业的发展，加快新型工业化进程；共同推进四川农业科技自主创新，大力发展现代农业；共同推进以企业为主体的技术创新体系建设，不断提升企业创新能力。

    徐部长强调，四川省与科技部建立省部工作会商机制这一举措，必将进一步加强部省合作，增强四川承接和参与国家重大科技计划的能力，推动四川科技进步和创新发挥十分重要的作用。并对绵阳科技城建设、成都高新区建设、钒钛新材料产业基地发展、推进体制机制改革、加快四川区域创新体系建设等部省共建问题作了重要指示。