2008年6月9日，科学技术部与重庆市人民政府在重庆召开了部市工作会商第二次会议。这是双方深入贯彻落实科学发展观和胡锦涛总书记为重庆发展作出的总体部署，探索更加紧密的合作模式，共同推进区域创新体系建设的又一具体行动。

    全国政协副主席、科技部部长万钢，重庆市委副书记、市长王鸿举，市委常委、宣传部部长何事忠，副市长童小平，市政协副主席吴家农、陈万志，科技部副部长尚勇，副秘书长王志学，重庆市委副秘书长周传航、市政府副秘书长罗广以及科技部和重庆市有关部门负责人出席了会议。王鸿举市长、万钢部长作了重要讲话。科技部副部长尚勇主持会议。

    去年双方进行了第一次工作会商，在双方主要领导的直接关心下，重庆科技创新取得了重要进展，围绕一批重大科技问题，双方合作取得富有成效的成果。在此基础上，今年会商双方围绕共建以高新技术产业为核心的重庆北部新区、推进科技金融结合试点、推动节能减排科技创新、推进城乡统筹发展科技创新和推进区域科技创新平台建设等五个议题进行了会商,达成了共识，并原则同意今年双方重点推进高新区、经开区、北部新区优势集成和创业风险投资引导试点工作，推动实施海上风电装备和绕城高速公路安全、节能、环保科技示范两项重大项目，共建国家冶炼装备系统集成工程技术研究中心和重庆科技检测中心两个重点科技基地和平台。

    王鸿举市长在讲话中指出，自去年重庆市政府与科技部建立部市会商机制以来，科技部对重庆不仅在工作层面给予了更多的指导和帮助，而且在重点项目及经费上也给予了更大的支持。他强调重庆市委市政府将一如既往地重视科技工作，并充分利用部市会商平台，加强与科技部的互动，推动重庆经济、科技的跨越式发展，为创新型国家建设作出新的更大贡献。

    万钢部长在讲话中充分肯定了重庆科技工作取得的良好成效，特别是会商一年来双方富有成效的良好合作。他指出，面对重庆发展新的形势要求，双方要在推动高新技术产业发展和产业升级、统筹城乡发展、节能减排、区域创新体系建设、营造激励创新良好环境等方面加强深入合作。并强调，在落实会商工作中要注重贯彻落实科学发展观、注重国家重大战略目标与重庆需求统一、注重体制机制创新、注重提升区域创新能力。会商商定的重大项目，要抓住重要环节，加强管理，务必取得实效。他相信，通过双方的共同努力，深入贯彻落实十七大精神，增强自主创新能力，科技创新在建设富裕、文明、和谐、开放的新重庆中必将发挥更加重要的作用。