近年来，根据党中央、国务院有关“稳疆兴疆，富民固边”、支持新疆又好又快发展等一系列重要指示精神，中国农科院进一步加大了援疆工作的力度，特别是2007年农业部召开第一次全国农业援疆工作座谈会后，中国农科院切实抓好农业援疆工作，认真制定援疆工作方案。院领导多次带领相关研究所的领导和专家深入新疆，实地研究和落实农业援疆工作，进一步加强了科技资源、科技成果在新疆的聚集，为支援新疆、建设新疆、科技兴疆发挥了积极作用，做出应有的贡献。

    （一）共同研究解决制约农业生产发展的关键技术问题。与新疆有关单位共同承担国家和地方科技项目60余项，经费5000多万元，在作物新品种选育、畜禽种质资源保存、哈密瓜、杏子深加工技术、节水技术等方面取得了显著成效，进一步带动了新疆自身农业科技实力的提升。

    （二）积极参与新疆科技平台建设，建设了6个研究中心（实验室）、5个试验站（基地）。与石河子大学联合共建了绿洲生态农业省部共建重点实验室；与新疆牧科院共同组建了“中国农业科学院新疆畜牧研究中心”等5个中心，在阿克苏建立了“中国农科院果树瓜类野外科学观测试验站”，在若羌县建立了“新疆若羌县红枣示范基地”，为提升新疆农业科技持续创新能力创造了条件。

    （三）为新疆产业升级提供技术支撑。每年在新疆推广棉花、马铃薯、果树、蔬菜等新品种50多个，推广蔬菜有机生态型无土栽培技术等新技术30多项，新品种和新技术推广面积达1100多万亩，有利地促进了新疆现代农业的发展。在作物生长的关键时期，选派专家到新疆举办培训和专题讲座，现场指导、培训生产和技术人员，并赠送大批技术资料，帮助解决生产实际问题，每年培训农牧民1万余人次。

    （四）为新疆培养大批优秀人才。“十一五”期间，中国农科院培养了新疆13名“西部之光”学者；为新疆培养农牧业高级研究和管理人才40余人，培养推广硕士25人；通过中国农科院的支持，石河子大学在作物栽培与耕作学和育种学学科成功申请了博士点。