2006年国防科工委加快发展先进造船能力，积极推进建立现代造船模式，加快提升自主创新能力，产业层次与技术水平进一步提升。一方面，按照规划布局，加快推进环渤海湾、长江口、珠江口规划内项目建设。2006年长兴、龙穴、海西湾造船基地等新增能力开始批量接单，使我国承接订单的能力大幅提升，新承接船舶订单超过“十五”造船完工量总和。另一方面，联合交通部等开展低质量船舶专项治理活动，对落后生产能力进行清理，关停并转457家造船企业。