2006年，商务部继续实施“万村千乡市场工程”。商务部已完成对各地商务主管部门报送的2006年“万村千乡市场工程”实施规划的核准工作。截止到6月底，共核准1817个试点县，备案2287个试点企业，分别比2005年增加134％和98.9％。目前，全国2862个县级单位中，已有63％的县（市区）参加“万村千乡市场工程”试点。

　　各地的试点规划呈现出以下特点：

　　一是各地参加试点的积极性高。2006年，西藏自治区首次报送了“万村千乡市场工程”实施规划。在全国申请加入试点的1837个县（区市）中，新申请加入的县（区市）有1075个，占58.5％；在申请加入试点的2624家企业中，新申请加入的企业1813个，占69.1％。河南省申请加入试点的145个企业中，有107个为新申请加入的企业，占申请加入试点企业数的73.8％。

　　二是各地区规划网点数大幅增加。按照各地上报的农家店建设规划数进行汇总，2006年全国各地共规划建设农家店25.9万个, 是2005年验收合格农家店数的4.31倍，其中拟建设村级店21.4万个,乡级店4.5万个；拟建配送中心1.1万个。山东、河南、江西、黑龙江、河北、四川、湖南等7省拟建农家店数超过1万个。

　　三是农资企业及邮政物流企业积极参与。2006年有624个农资企业成为“万村千乡市场工程”试点企业，占试点企业总数的27.3%，比2005年提高了近10个百分点。邮政物流企业也积极参与“万村千乡市场工程”，有13家邮政企业成为试点企业，比2005年增加了9家，拟建农家店3000个，比2005年邮政试点企业建设的合格农家店数增加了51.5％。

　　四是试点企业实力有所提高。2006年“万村千乡市场工程”试点企业注册资本均在100万元以上，平均注册资本为851万元。试点企业实施2006年“万村千乡市场工程”，计划总投资240亿元，其中贷款140亿元。